نهاد‌های ناظر انتخاباتی از عدم همخوانی فهرست رای دهندگان در شماری از مراکز رای‌ دهی ابراز نگرانی می کنند. آنان می‌گویند که عدم همخوانی فهرست رای دهندگان مشارکت مردم را کم ‌رنگ کرده است. سخنگوی بنیاد انتخابات شفاف افغانستان به رسانه ها گفته که بزرگترین چالش روند انتخابات عدم همخوانی فهرست رای دهندگان است.